Hallo,
Gibt es überhaupt noch so etwas wie ein Wertminderungsausgleich? Ich glaube das ist mal abgeschaft worden. Instandsetzung via Klebe -oder Foliertechnik würde ich auch ablehnen, weil Folien ja wohl nur eine beschränkte Lebenserwarung haben.
Würde mir überlegen, den Schaden von der Versicherung ausbezahlen zu lassen und abwägen, ob die Instandsetzung wirklich nötig ist, man kann die Dellen sich ja schön reden und sie aufs dünne Alublech schieben und aufs Dach siehst ja eh nicht. 
Kaufst Du dir für das Geld einen schicken Dachträger....
Wenn der Sachverständige nicht kompetent oder der Schaden dir zu gering bemessen erschien, dann würde ich in jedem Fall eine weitere Meinung einholen, ist ja dein gutes Recht als Versicherter und Geschädigter.
Gruß